Kemarin saya membaca sebuah artikel yang dapat memanfaatkan Daphnia sebagai model, pertanyaan teoritis yang sangat penting dari peran ukuran populasi efektif dalam merujuk mempelajari beban genetik. The aspect’m menyadari teoritis, tapi saya tidak tahu banyak tentang, Daphnia . Makalah ini berjudul beban genetik, perkawinan sedarah depresi dan heterosis covary dengan ukuran populasi: evaluasi empiris prediksi teoritis, dan itu adalah Evolution . Hal ini tidak membuka akses, dan saya dapat sebuah preprint, yang saya tidak membuat permintaan maaf menemukan. Salah satu alasan yang menarik minat saya, bahwa mereka mengatakan:

Hasil kami jelas menunjukkan model teoritis lebih suka berdasarkan berulang alel mutasi efek tentu berbahaya pada ukuran populasi penangkaran sanak depresi, kekuatan hibrida, dan beban genetik. Ini adalah studi pertama yang menemukan bukti yang jelas dan tidak ambigu seperti untuk semua efek yang diantisipasi.

Ini membuat saya berpikir tentang Richard Lewontin menegaskan pada tahun 1970 bahwa genetika populasi teoritis pada dasarnya sebuah mesin untuk operasi pada input yang tidak tersedia (data ) telah dikembangkan. Aku tidak tahu cukup baik sastra itu, tapi mengejutkan bahwa gagasan-gagasan ini hanya kuat sekarang diuji!

adalah

Masalah mendasar adalah bahwa dalam populasi kecil pergeseran genetik memiliki potensi untuk mendominasi kekuatan pilihan dalam pembersihan alel berbahaya. Bagaimana alel berbahaya bervariasi. Beberapa alel memiliki pilihan koefisien negatif yang sangat kuat. Misalnya, orang-orang dengan efek mematikan dominan akan segera dibersihkan untuk alasan yang jelas (jika dominan, masih diucapkan, dan jika itu mematikan, tidak diteruskan). Situasi ini berbeda untuk orang dengan bentuk resesif ekspresi. Bahkan jika itu adalah mematikan dalam bentuk homozigot, alel bisa eksis pada frekuensi rendah, jika populasi kawin acak dan sebagian besar salinan akan heterozigot, yang kebugaran tidak ketat. Namun, jika koefisien pilihan rendah cukup, tapi bahkan alel dominan menyatakan tidak dapat dibersihkan. Penyimpangan dalam frekuensi alel dengan sampling berbanding terbalik dengan penduduk untuk berkumpul dengan tingkat keputusan dalam hal ukuran, akan mengurangi efisiensi seleksi alam. Hal ini di pusat teori hampir netral, menunjukkan bahwa banyak perubahan karena alel merugikan sangat rendah, dapat dibersihkan dalam ukuran populasi di mana untuk memasuki aliran di atas ambang tertentu.

Mungkin populasi besar ada banyak jenis-frekuensi rendah efek berbahaya lemah dan ekspresi resesif menjadi. Sebaliknya, kekuatan populasi kecil adalah aplikasi sehingga bahkan alel sangat berbahaya ditentukan terhadap pilihan gradien. Tentang lintas tujuan dengan gagasan bahwa karena populasi bawaan cenderung “mengekspos” alel resesif pilihan mereka bisa mengekspresikan “membersihkan” beban genetik yang mengacu pada kebugaran. Misalnya, dengan jenis anjing ada beberapa bukti bahwa perkawinan sedarah perlu dibersihkan dari tingkat variasi ras dan beberapa beban. Jadi untuk menguji

Tentu saja, Daphnia jenis yang menunjukkan variasi gradien macam keragaman genetik (heterosigositas dalam hal ini) berbagai hipotesis melintasi pohon anggur dari populasi liar di sampel laboratorium . Perbedaan penentuan molekul mereka adalah ~ 30 mikrosatelit lokus. Apa yang mereka temukan adalah bahwa sampel sesuai dengan prediksi teoritis dari orang-orang dari populasi yang besar memiliki banyak pemisahan alel berbahaya, yang tercermin dalam efek penangkaran sanak kuat jika individu dengan tujuan seperti genetik yang sama menyeberang. Sebaliknya, populasi kecil tidak memberikan banyak efek inbreeding, yang berarti bahwa banyak alel berbahaya sudah tetap dan menunjukkan begitu terkena. Individu-individu dalam populasi kecil juga telah mencerminkan kebugaran yang lebih rendah daripada yang dari populasi yang besar, kemungkinan beban genetik mereka. Menyeberangi orang dari berbagai populasi kecil langsung memimpin pasukan hybrid, sebagai varian tetap berbeda anggur.

Ada lebih banyak detail untuk bekerja. Jika Anda memiliki pendekatan akademis, membaca semuanya. Jika tidak, selalu ada #icanhazpdf a. Saya lebih tertarik pada Umum kesimpulan. Dua Pracetak baru saja keluar bahwa realitas, Neanderthal tampaknya diarahkan ukuran populasi kecil yang efektif memiliki. Sementara itu, masalah ini sangat nyata dan hidup dalam genetika konservatif, dan bahkan pemahaman garis mamalia luar, banyak dari mereka melewati kemacetan, dan campur tangan manusia di samping. Namun, seperti yang kita menggeneralisasi Daphnia bahwa genom kecil (& amp; lt; 10% dari ukuran genom manusia, rata-rata untuk mamalia) atau ~ 1/3 dari gen? Saya akan bertaruh banyak. Tapi aku akan benar-benar tertarik jika analisis seluruh genom dari jenis ini di Daphnia dilakukan, dan kita dapat melihat di lokasi frekuensi spektrum dan untuk menyimpulkan tidak hanya dari kesehatan.

Akhirnya, saya ingin menekankan bahwa banyak masalah yang terkait dengan perkawinan sedarah tampaknya varian resesif dari frekuensi rendah karena beban pemisahan bagian resesif. Ini adalah wawasan dasar penting untuk hamil kita benar-benar tahu apa yang terjadi dalam populasi kecil, atau saham yang telah melewati hambatan memungkinkan, dan mengapa hal itu masalah.


Tinggal kode